זוהי אפליקציית לינוקס בשם QSdpR שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור run1.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם QSdpR עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
QSdpR
Ad
תיאור
זוהי תוכנת שחזור quasispecies ויראלית לבעיית הרכבה quasispecies על וירוסי mRNA, המבוססת על גישת clustering correlation ומשתמשת במסגרת אופטימיזציה למחצה מוגדרת. התוכנה מקבלת גנום התייחסות, ערכת קריאה של NGS המיואמת להתייחסות זו ולסט של מיקומי SNP בצורה של קובץ vcf ומוציאה סט אופטימלי של גנומים מינים משוחזרים המתארים את האוכלוסייה הוויראלית הבסיסית.
תכונות
- קוואזי מינים
- וירוס mRNA
- אשכולות
- תוכנית חצי מוגדרת
- וירוס HIV-1
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
Unix Shell, Python, C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/qsdpr/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
