זוהי אפליקציית לינוקס בשם qure שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור QuRe_v0.99971.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם qure עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
קוור
תיאור
QuRe היא תוכנית לשחזור quasispecies ויראלי, שפותחה במיוחד לניתוח נתוני NGS שנקראו ארוכות (>100 bp). התוכנה מבצעת יישור של קטעי רצף כנגד גנום ייחוס, מוצאת חלוקה מיטבית של הגנום לחלונות הזזה בהתבסס על כיסוי וגיוון ומנסה לשחזר את כל הרצפים הבודדים של ה-quasispecies הנגיפי - יחד עם השכיחות שלהם - באמצעות היוריסטיקה אלגוריתם, התואם התפלגות רב-נומית של וריאנטים ויראליים מובהקים החופפים על פני חלוקת הגנום. QuRe מגיע עם שיטת תיקון שגיאות מובנית של Poisson וציבור הסתברותי לאחר שחזור, שניהם מותאמים לפרמטרים על שיעורי שגיאה נתונים באזורים הומופולימריים ולא הומופולימריים.זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/qure/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
