זוהי אפליקציית לינוקס בשם Virmid שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם Virmid-1.2.0.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Virmid עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
וירמיד
תיאור
חדשות:
11-07-2013 הועלתה גרסה חדשה של Virmid 1.1.0.
08-29-2013 מאמר Virmid מתפרסם כעת ב- Genome Biology.
Kim S וחב', "Virmid: זיהוי מדויק של מוטציות סומטיות עם מסקנות לזיהום מדגם", Genome Biology 2013, 14:R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdissection for calling SNP) הוא מתקשר עם גרסה מבוססת Java המיועד לדגימות מותאמות לבקרת מחלות. Virmid מתמחה גם בזיהוי פוטנציאל בתוך זיהום אינדיבידואלי שבו לא ניתן לטהר מספיק את דגימת המחלה. בעוד שקצב קריאת ה-SNP נפגע באופן חמור עם ההטרוגניות הזו, Virmid יכול לחשוף SNPs עם תדירות אללים נמוכה על ידי התחשבות ברמת הזיהום (אלפא). התכונות החשובות של Virmid הן:
•הערכה של פרופורציה מדויקת של דגימת בקרה בדגימת מחלה (מעורבת).
• שיפור SNP וקריאה למוטציה סומטית ביחס לשיעור המשוער
תכונות
- מציאת מוטציות סומטיות
- מסקנת טומאה לדוגמא
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/virmid/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
