זוהי אפליקציית Windows בשם GENIE (GEne-geNe Interaction) שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה כ-GENIE_src.tar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם GENIE (GENE-geNe Interaction) עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
GENIE (אינטראקציה של GEne-gene)
Ad
תיאור
אינטראקציה בין גנים לגנים במחקרי קשר גנטי היא אינטנסיבית מבחינה חישובית כאשר מעורבים מספר רב של SNPs. לרוב יחידות העיבוד המרכזיות העדכניות ביותר (CPUs) יש מספר ליבות, בעוד ליחידות עיבוד גרפיות (GPU) יש גם מאות ליבות והן שימשו לאחרונה ליישום תוכנה מדעית מהירה יותר. עם זאת, כיום אין חבילות תוכנה לניתוח גנטי המאפשרות למשתמשים לנצל באופן מלא את כוח המחשוב של התקנים מרובי ליבות אלה לניתוח אינטראקציה גנטית עבור תכונות בינאריות.
כאן אנו מציגים חבילת תוכנה חדשה GENIE, אשר מנצלת את הכוח של מספר ליבות GPU או מעבד CPU כדי להקביל את ניתוח האינטראקציה.
ציטוט: Chikkagoudar, S., Wang, K., & Li, M. (2011). GENIE: חבילת תוכנה לניתוח אינטראקציה בין גנים לגנים במחקרי קשר גנטי באמצעות ליבות GPU או CPU מרובות. הערות מחקר של BMC, 4(1), 158.
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/gpugenie/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
