זוהי אפליקציית Windows בשם Javamony שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם Javamony.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Javamony עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
Javamony
תיאור
מבוסס על ה-Pysimony הלא כל כך מוצלח (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), אותו תלמיד נחוש נוקט שוב בבעיה הפילוגנטית.
Javamony מופעל באופן הבא:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [אקראי / צעדים (עץ מתחיל)] [מספר רצועות אתחול] [טקסון קבוצת חוץ מס' 1] [טקסון קבוצת חוץ מס' 2] ...
לא אמורה להיות תוכנית היסק פילוגנטי תחרותי, Javamony היא הזדמנות עבורי לרכוש את שפת ג'אווה תוך כדי למידה לטפל ולפתור בעיות יסוד בפילוגנטיה. לכן, לטובתי החינוכית, כל הקוד מקורי. כמובן, יש כנראה גם הרבה טעויות.
אני מפיץ את Javamony, כמו שעשיתי את Pysimony, בתקווה שיהיה לו ערך חינוכי למישהו אחר או לפחות משעשע במעורפל.
התכונות הקרובות יהיו:
- תמיכה ברצפי חומצות אמינו
- תמיכה בפורמטים נוספים של קבצים (למשל Nexus)
- ריבוי השחלות
- שיטות ניקוד נוספות (למשל סבירות מקסימלית)
תכונות
- משתמש בזלזול מירבי
- קורא קובץ קלט FASTA (DNA בלבד)
- קבוצה חיצונית שהוקמה על ידי המשתמש
- עצים מתחילים באקראי ובתוספת שלב
- משתמש בחיפוש עצים SPR (גיזום תת-עץ והשתלה מחדש).
- מבצע אתחול
- פלט פורמט Newick סטנדרטי עם תמיכה באתחול ואורכי ענפים
- מצייר עץ סופי עם תמיכה ברצועת אתחול
קהל
מדע/מחקר, חינוך
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/javamony/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
