זוהי אפליקציית Windows בשם Universal-mer אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-Universal-MerV1.0.0.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Universal-mer עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
יוניברסל-מר
תיאור
Universal-Mer הוא כלי לספירת k-mer עבור כל הגדלים האפשריים של k בבת אחת. יותר מכלי ספירה טיפוסיים של k-mer, התוכנית יכולה לסכם את תוצאת הספירה המדויקת של 1-mers ל-l-mers בבת אחת כאשר l = אורך המשנה החוזרת הארוכה ביותר ברצף הקלט, כאשר כעת האורך המרבי מוגדר ל-100000- mers. התוכנית יכולה לדווח בדיוק על המספר של כל החזרות (freq>1) והייחודיות (freq = 1) Mers, ומספר כל המחרוזות האפשריות של רצפים מבלי לחתוך כל מרס בתדר נמוך.
קבצי קלט יכולים להיות בפורמט טקסט או מהיר. אלפבית הקלט כעת הוא רק {A, C, G, T}. קבצי טקסט הקלט יהיו מודאגים כפורמט מהיר ללא שורת תיאור. לאחר ספירה ובניית מסד הנתונים של כל האורך האפשרי k-mer של k-mer, המשתמש יכול לבחור בתפריט כל גודל של k כדי לספור היסטוגרמה, לזרוק k-mers, לבצע שאילתות על תת-מחרוזת ולסכם את כל ה-k האפשריים.
תכונות
- סכמו 1-מרים חוזרים וייחודיים ל-l-mers כאשר l = האורך הארוך ביותר של חזרות
- ספור היסטוגרמה של k-mers כאשר 1<=k<= אורך רצף קלט
- ספור היסטוגרמה של k-mers קנוניים כאשר 1<=k<= אורך רצף קלט
- dump k-mers כאשר 1<=k<= אורך רצף קלט
- זרוק k-mers קנוניים כאשר 1<=k<= אורך רצף קלט
- שאילתה של k-mer בכל גודל של k שבו k<=200000 ברצפי הקלט.
- מצא את המחרוזת החוזרת הארוכה ביותר של רצף קלט.
ממשק משתמש
קונסולה/מסוף, שורת פקודה
שפת תכנות
C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מאתר https://sourceforge.net/projects/universal-mer/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
