זוהי אפליקציית Windows בשם VarScan שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור VarScan.v2.3.9.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם VarScan עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
VarScan
תיאור
זיהוי וריאנטים ברצף מקביל מסיבי. עבור מדגם אחד, קורא SNPs, indels, וגנוטיפים קונצנזוס. עבור זוגות נורמליים של גידול, מסווג כל וריאנט כ-Germline, Somatic או LOH, ומזהה גם שינויים במספר עותק סומטי. הגרסה העדכנית ביותר זמינה ב-GITHUB
תכונות
- קורא ל-SNPs ו-Indels מקבצי גירמה של SAMtools
- מסנן גרסאות לפי כיסוי, עומק קריאה, תדירות גרסאות ואיכות בסיס
- קובע מצב סומטי (Somatic, Germline, LOH) עבור זוגות גידול נורמלי
- משווה, ממזג וחותך שתי רשימות של גרסאות
- מגביל קריאות וריאנטים לקבוצה של מיקומי יעד או אזורי יעד
- חינם לשימוש לא מסחרי.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/varscan/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
