これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cmtk-lsba です。
プログラム:
NAME
lsba - 地方投票。
SYNOPSIS
lsba [オプション] targetImage atlasIntensity1 atlasLabels1 [atlasIntensity2 atlasLabels2
[...]]
DESCRIPTION
このツールは、同時登録され再フォーマットされた複数のバイナリ セグメンテーションを結合します。
ローカルで重み付けされた形状ベースの平均化を使用するアトラス。
OPTIONS
グローバル BHツールキット オプション (これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします(非推奨。下位互換性のためにサポートされています)。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します(POSIXスレッドおよびOpenMPの場合)。
入力 オプション
-- パディング値の設定
入力強度画像のパディング値を設定します。 この値のピクセルは無視されます。
[ディフォルト: 無効]
ラベル 組み合わせ オプション
--パッチ半径
ローカル類似性の計算に使用される画像パッチの半径(ピクセル単位)。 [ディフォルト:
5]
-検索半径
ローカル画像パッチマッチングの検索半径。 アルゴリズムは最適なものを見つけます
徹底的な検索により、この半径内にパッチを適用します。 [ディフォルト: 0]
--no-local-外れ値
形状ベースの平均化手順で局所外れ値を検出して除外します。
--no-global-外れ値
相関性の低いアトラスを削除する前に、グローバルな外れ値を検出して除外します
ローカルSBA手順。
出力 オプション
- 出力 , -o
出力画像のファイルシステムパス。 [ディフォルト: lsbo.nii ]
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-lsba を使用する