cmtk-mrbias - クラウドでオンライン

プログラム：

NAME

mrbias - MR 画像の強度バイアス フィールド補正

SYNOPSIS

バイアス 入力画像 出力画像

DESCRIPTION

このプログラムは、バイアスフィールドを使用してMR画像の強度不均一性アーティファクトを修正します。
エントロピー最小化によって推定されます。

OPTIONS

グローバル BHツールキット オプション （これら 　 shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。

--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。

--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。

- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。

--xml
コマンドライン構文仕様をXMLマークアップで記述します（スライサー統合用）。

- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。

- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。

--詳細レベル
詳細レベルを設定します。

-詳細, -v
詳細レベルを1増やします（非推奨。下位互換性のためにサポートされています）。

-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します（POSIXスレッドおよびOpenMPの場合）。

バイアス フィールド パラメータ化
--度数追加 , -A
加法補正のための多項式次数。 [ディフォルト： 0]

--度数 , -M
乗法補正のための多項式の次数。 [ディフォルト： 2]

- 増分, -I
多項式の次数を段階的に増やします。

入力 画像 前処理
-- パディング値の設定
入力強度画像のパディング値を設定します。この値を持つピクセルは無視されます。
[ディフォルト： 無効]

- マスク , -m
バイナリマスクイメージのファイル名。 [ディフォルト： なし]

--しきい値 , -t
画像の前景の最小強度しきい値。 [ディフォルト： 無効]

--しきい値 , -T
画像の前景の最小強度しきい値。 [ディフォルト： 無効]

--thresh-auto
画像前景の最小強度閾値の自動選択
画像のノイズレベルの推定。

--thresh-otsu-nbins
これが正の整数の場合、自動最小強度閾値選択を使用します
指定された数のヒストグラムビンを使用して Otsu しきい値処理によって画像の前景を抽出します。
[ディフォルト： 0]

エントロピー 推定 設定
--log 強度, -L
エントロピー推定には対数強度を使用します。

--サンプリング密度 , -s
画像ピクセルのサブセットのみを使用する画像サンプリング密度 [ディフォルト： 無効]

--num-bins , -n
エントロピー推定のためのヒストグラムビンの数 [ディフォルト： 256]

最適化 アルゴリズム 設定
--ステップ最大
最大（初期）検索ステップ サイズ。 [ディフォルト： 1]

--ステップ分
最小（最終）検索ステップ サイズ。 [ディフォルト： 0.1]

入力 と 出力 オプション
--インポートバイアスの追加
加法バイアス フィールドをインポートします (最適化を無効にします)。 [ディフォルト： なし]

--import-bias-mul
乗法バイアス フィールドをインポートします (最適化を無効にします)。 [ディフォルト： なし]

--write-bias-add
加法バイアス フィールドの出力のファイル名。 [ディフォルト： なし]

--write-bias-mul
乗法バイアス フィールドの出力のファイル名。 [ディフォルト： なし]

--write-float, -F
出力画像を浮動小数点ピクセルデータで書き込む。これが指定されていない場合は、入力
データ型が使用されます。

画像/変換 データベース
--db
新しく作成されたもので更新する必要がある画像/変換データベースへのパス
画像。 [ディフォルト： なし]

作者

Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinR​​からの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko

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