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OnWorksファビコン

cmtk-sympl - クラウドでオンライン

Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターを介して OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで cmtk-sympl を実行します。

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cmtk-sympl です。

プログラム:

NAME


sympl - 対称面の計算

SYNOPSIS


単純な 入力画像

DESCRIPTION


画像のおおよその対称面を計算して、たとえば中間面を決定します。
人間の脳画像の矢状面。 書き込みなど、さまざまな出力形式がサポートされています。
対称面が描画された入力画像、またはそれに沿って再配置された入力画像
対称面。

OPTIONS


グローバル BHツールキット オプション (これら   shared by CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。

--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。

--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。

- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。

--xml
コマンドライン構文仕様をXMLマークアップで記述します(スライサー統合用)。

- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。

- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。

--詳細レベル
詳細レベルを設定します。

-詳細, -v
詳細レベルを1増やします(非推奨。下位互換性のためにサポートされています)。

-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します(POSIXスレッドおよびOpenMPの場合)。

最適化
- 正確さ , -a
精度 ([mm] 単位の最終最適化ステップ サイズ。 [ディフォルト: 0.1]

- サンプリング , -s
リサンプリングされた画像の解像度。 これは、最初の (最も細かい) 解像度 [mm] です。
マルチスケール ピラミッドでリサンプリングされた画像。
元のフル解像度の画像。 [ディフォルト: 1]

-レベル , -l
解像度レベルの数。 アルゴリズムは (level-1) リサンプリングされた画像を作成します
ますます粗い解像度で、これらを昇順で使用します。
最終レベルで元の画像を使用する前の解像度。 [ディフォルト: 4]

初期 近似 対称 飛行機 オリエンテーション
-- 初期平面
対称面の初期方向。 これは、最も近い直交平面でなければなりません
予想される実際の対称面。 サポートされている値: 「initial-axial」、「initial-axial」
コロナル」、「イニシャルサジタル」、「イニシャル-xy」、「イニシャル-xz」、「イニシャル-yz」、
デフォルトは「initial-sagittal」、または次のいずれかを使用します。

-- 初期軸
ほぼ軸対称

-- イニシャル冠状
ほぼ冠状対称

-- 初期サジタル
ほぼ矢状対称 [この is   ディフォルト]

--イニシャル-xy
ほぼXY面対称

--イニシャル-xz
ほぼ XZ 面対称

--initial-yz
ほぼYZ面対称 [この is   ディフォルト]

事前計算済み 対称
--出力のみ
オプションとして対称パラメータ [Rho Theta Phi] を指定し、検索をスキップします。 [ディフォルト: 無効]

-- 出力専用ファイル
ファイルから対称パラメータを読み取り、検索をスキップします。 [ディフォルト: 無効]

Rescale データ 前処理
--最小値
最小データ値を強制します。 [ディフォルト: 無効]

--最大値
最大データ値を強制します。 [ディフォルト: 無効]

出力 of 画像
- 補間
再フォーマットされた出力データに使用される補間方法 サポートされている値: "linear"、
"cubic"、"sinc" (デフォルトは "linear")、または次のいずれかを使用します。

- 線形, -L
出力に線形イメージ補間を使用します。 [この is   ディフォルト]

- キュービック, -C
出力にキュービック イメージ補間を使用します。

--sinc, -S
出力にコサイン ウィンドウ sinc イメージ補間を使用します。

--パッドアウト , -P
出力画像のパディング値。 [ディフォルト: 無効]

--マーク値
対称面をマーク (描画) するためのデータ値。 [ディフォルト: 4095]

--書き込みマーク
対称面がマークされた出力イメージのファイル名。 [ディフォルト: なし]

--書き込み整列
対称平面に位置合わせされた出力イメージのファイル名。 [ディフォルト: なし]

--マーク整列
位置合わせされた出力イメージで対称面をマークします。

--書き込み減算
ミラー差分画像のファイル名。 [ディフォルト: なし]

--書き込みミラー
対称面に対して鏡像化されたイメージのファイル名。 [ディフォルト: なし]

出力 of Parameters
--outfile , -o
対称面パラメーター出力のファイル名。 [ディフォルト: なし]

--write-xform
アフィン アラインメント変換をファイルに書き込む [ディフォルト: なし]

作者


Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinR​​からの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko

onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-sympl を使用する


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