これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド cmtk-vol2csv です。
プログラム：
NAME
vol2csv - 地域のボリュームを計算し、CSV ファイルに書き込みます。
SYNOPSIS
vol2csv 領域画像密度画像
DESCRIPTION
このツールは、ラベル イメージ内の領域のボリュームを計算します。 オプションで密度を受け入れます
(例えば、異なる組織) をマップし、領域ごとのコンテンツを計算して出力します。
各。 また、このツールは、オプションの「ピクセル ボリューム」マップを受け入れて、ローカル ピクセルを考慮することができます。
空間的な歪みなどによるボリュームの変動。
OPTIONS
グローバル BHツールキット オプション （これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします（非推奨。下位互換性のためにサポートされています）。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します（POSIXスレッドおよびOpenMPの場合）。
入力 オプション
--正規化密度
密度画像のオプションの正規化係数。 通常、
密度画像は 0..1 の範囲にある必要がありますが、多くの場合、そのような画像は次のようにスケーリングされます。
整数としてのストレージに対応するためのさまざまな範囲。 たとえば、密度が
値 0..255 として保存されている場合は、このパラメーターを 255 に設定します。 [ディフォルト： 1]
--ラベルファイル
提供されている場合、このテキスト ファイルには、領域イメージ内のすべてのラベルの名前が含まれています。 これらは
名前は、CSV 出力の行にラベルを付けるために使用されます。 [ディフォルト： なし]
補正 オプション
-- ピクセル倍率
提供されている場合、このグローバル スケール係数がすべてのピクセル ボリュームに適用され、補正されます。
世界と画像の縮尺の間の偏差。 [ディフォルト： 1]
-- ピクセルスケール画像
指定されている場合、このボリュームには各ピクセルのボリュームの倍率が含まれます。 これは
通常、空間的な歪みのない変形のヤコビ行列式マップです。 [ディフォルト：
なし]
出力 オプション
--密度ラベル
このオプションは、次のように使用される密度マップのラベルを提供するために使用できます。
出力の列ラベル。 ラベルはコンマで区切る必要があります。
エスケープされていないスペース。 [ディフォルト： なし]
- 出力 , -o
指定した場合、プログラム出力はこのファイルに書き込まれます。 提供されない場合、出力は
STDOUT ストリームに書き込まれます。 [ディフォルト： なし]
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用してオンラインで cmtk-vol2csv を使用する
