これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fpromlke です。
プログラム：
NAME
fpromlk - 最尤法によるタンパク質の系統発生
SYNOPSIS
フロムルク -シーケンス シークセットオール -インツリーファイル ツリー [-カテゴリ 整数] -割合 配列
-カテゴリー プロパティ [-重み プロパティ] -長さ boolean [-モデル リスト]
[-ガンマ リスト] -ガンマ係数 フロート -ngamacat 整数 -不変係数 フロート
-ニンバーキャット 整数 -インバルフラク フロート -nhmmカテゴリ 整数 -hmrates 配列
-hmm確率 配列 -adjsite boolean -ラムダ フロート -ごちゃまぜ 整数
-シード 整数 -グローバル boolean [-アウトグルノ 整数] -outfile アウトファイル [-マス トグル]
-アウトツリーファイル アウトファイル [-印刷データ boolean] [-進捗 boolean] [-ツリープリント boolean]
[-ヒプステート boolean]
フロムルク -助けて
DESCRIPTION
フロムルク EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「系統発生:分子配列」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シークセットオール
XNUMX つ以上の配列アライメントを含むファイル
-インツリーファイル ツリー
-カテゴリ 整数
デフォルト値：1
-割合 配列
-カテゴリー プロパティ
-重み プロパティ
NEW
-長さ boolean
デフォルト値：N
-モデル リスト
デフォルト値: ジョーンズ・テイラー・ソーントン
-ガンマ リスト
デフォルト値: n
-ガンマ係数 フロート
デフォルト値：1
-ngamacat 整数
デフォルト値：1
-不変係数 フロート
デフォルト値：1
-ニンバーキャット 整数
デフォルト値：1
-インバルフラク フロート
デフォルト値：0.0
-nhmmカテゴリ 整数
デフォルト値：1
-hmrates 配列
デフォルト値：1.0
-hmm確率 配列
デフォルト値：1.0
-adjsite boolean
デフォルト値：N
-ラムダ フロート
デフォルト値：1.0
-ごちゃまぜ 整数
-シード 整数
デフォルト値：1
-グローバル boolean
デフォルト値：N
-アウトグルノ 整数
出力
-outfile アウトファイル
-マス トグル
デフォルト値：Y
-アウトツリーファイル アウトファイル
-印刷データ boolean
デフォルト値：N
-進捗 boolean
デフォルト値：Y
-ツリープリント boolean
デフォルト値：Y
-ヒプステート boolean
デフォルト値：N
onworks.net サービスを使用してオンラインで fpromlke を使用する
