これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションの4つを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドgapXNUMXです。
プログラム:
NAME
gap4-ゲノムアセンブリプログラム(stadenパッケージの一部)
SYNOPSIS
ギャップ4 [-ろ] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [データベース名.V]
DESCRIPTION
Gap4はゲノムアセンブリプログラムです。 プログラムには、次のようなすべてのツールが含まれています
アセンブリプログラムに加えて、多くの独自の機能と非常に簡単に使用できるものから期待されます
インターフェース。 元のバージョンは、Bonfield、JK、Smith、KF、およびStaden、Rで説明されていました。 A
新しいDNA配列アセンブリプログラム。 核酸解像度。 24、4992-4999(1995)
Gap4は非常に大きく強力です。 誰もがオプションのサブセットを採用し、
それらにアクセスして使用するためのお気に入りの方法。 たくさんありますが、ユーザーは
ドキュメント全体を一度読んで、何が何であるかを発見することをお勧めします
可能であり、自分の仕事に最も適した方法です。 少なくとも、この全体
長い目で見れば、時間を節約できるので、導入の章を読む必要があります。
OPTIONS
-ろ 読み取り専用の
-maxseq N
初期の最大総コンセンサス長
-maxdb N
コンティグの初期最大数+測定値
-(no_)チェック
(しないでください)DBを開いたときにデータベースのチェックを実行します
-(no_)exec_notes
(しないでください)データベースを開いたときにOPEN / CLOSノートを実行します
-(no_)rawdata_note
(しないでください)RAWDATAenvの代わりにRAWDノートを使用してください。 変数
-(no_)csel
(しないでください)dbを開いたときにコンティグセレクターを起動します
-表示
使用するXディスプレイ
-ビットサイズ N
新しいデータベースの補助ファイルのビットサイズを指定します(32/64)
- 同期 ディスプレイサーバーに同期モードを使用する(デバッグ)
-- 引数リストの終わり
onworks.netサービスを使用してgap4をオンラインで使用する