これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gbseqget です。
プログラム：
NAME
gbseqget - GenBank からのシーケンスを XML GBSet としてフォーマットします
SYNOPSIS
gbseqget [-] [-d ファイル名] [-i ファイル名] [-m n / p / b] [-n] [-o ファイル名] [-v]
DESCRIPTION
gbseqget GenBank から生物学的配列データを取得します (GI の入力リストに従って)
アクセッション番号) を取得し、XML GBSet ドキュメントとして出力します。
OPTIONS
オプションの概要は以下に含まれています。
- 使用状況メッセージを印刷する
-d ファイル名
日付リストのファイル名を入力します（必要なアクセッション、XNUMX行にXNUMXつ、その後に
空白行と許可された日付のリスト、これもXNUMX行にXNUMXつ）
-i ファイル名
GIリストの入力ファイル名（デフォルト= stdin）
-m n / p / b
分子タイプ：
nヌクレオチド（デフォルト）
pプロテイン
b両方
-n 新しいレコードのみを返します（指定されたGIが古いバージョンを参照している）
-o ファイル名
XML GBSet の出力ファイル名 (デフォルト = stdout)
-v SNPバリエーションを取得する
注意事項
GBSet 形式は非推奨になり、INSDSet が優先されます。INSDSet は次のコマンドを実行して生成できます。
insdseqget 代わりに gbseqget.
onworks.net サービスを使用してオンラインで gbseqget を使用する
