これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gmx-pme_error です。
プログラム：
NAME
gmx-pme_error - 指定された入力ファイルで PME を使用した場合のエラーを推定します
SYNOPSIS
gmx pme_error [-s [<.tpr>]] [-o [<.out>]] [-それで [<.tpr>]] [-ベータ ]
[-[いいえ]曲] [-自己 ] [-シード ] [-[no] v]
DESCRIPTION
GMX pme_error sPME アルゴリズムを使用する場合、静電力の誤差を推定します。
旗 -曲 誤差が等しくなるように分割パラメータを決定します。
実空間部分と逆空間部分に分散されます。 エラーの原因となる部分
粒子の自己相互作用のため、計算量が多くなります。 ただし、良い
近似は、この項に粒子の一部を使用することです。
旗で示される -自己.
OPTIONS
入力ファイルを指定するオプション：
-s [<.tpr>] （topol.tpr）
ポータブルxdr実行入力ファイル
出力ファイルを指定するオプション：
-o [<.out>] (エラー.アウト)
一般的な出力ファイル
-それで [<.tpr>] （tuned.tpr） （オプション）
ポータブルxdr実行入力ファイル
その他のオプション：
-ベータ （-1）
正の場合、ewald_beta を上書きします。 .tpr この値を含むファイル
-[いいえ]曲 （いいえ）
誤差が均等に分散されるように分割パラメータを調整します。
実空間と逆空間
-自己 (1)
0.0 と 1.0 の間の場合、この部分だけから自己相互作用誤差を決定します。
荷電粒子
-シード (0)
モンテカルロアルゴリズムに使用される乱数シード -自己 値に設定されています
0.0と1.0間
-[no] v （いいえ）
大声で騒々しい
onworks.net サービスを使用してオンラインで gmx-pme_error を使用する
