これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドgmx-viewです。
プログラム：
NAME
gmx-view-X-Windowsターミナルで軌跡を表示する
SYNOPSIS
gmxビュー[-f [<.xtc / .trr / ...>]] [-s [<.tpr>]] [-n [<.ndx>]] [-b ]
[-e ] [-DT ]
DESCRIPTION
GMX ビュー GROMACSトラジェクトリビューアです。 このプログラムは、軌道ファイルを読み取り、実行します
入力ファイルとインデックスファイルを使用して、分子の3D構造を標準のXにプロットします。
ウインドウスクリーン。 ハイエンドのグラフィックワークステーションは必要ありません。モノクロでも動作します。
画面。
次の機能が実装されています：3Dビュー、回転、平行移動、スケーリング
分子の、原子のラベル、軌道のアニメーション、PostScriptのハードコピー
フォーマット、ユーザー定義のアトムフィルターはMIT-X（実際のX）で実行され、ウィンドウとモチーフを開き、ユーザー
フレンドリーなメニュー、周期性を削除するオプション、計算ボックスを表示するオプション。
より一般的なXコマンドラインオプションのいくつかを使用できます。 -bg, -fg 色を変える、 -フォント
フォント名 フォントを変更します。
OPTIONS
入力ファイルを指定するオプション：
-f [<.xtc / .trr / ...>] （traj.xtc）
軌道： xtc てら CPT gro g96 pdb tng
-s [<.tpr>] （topol.tpr）
ポータブルxdr実行入力ファイル
-n [<.ndx>] （index.ndx） （オプション）
インデックスファイル
その他のオプション：
-b (0)
軌道から読み取る最初のフレーム（ps）
-e (0)
軌道から読み取る最後のフレーム（ps）
-DT (0)
t MOD dt =初回（ps）の場合にのみフレームを使用します
KNOWN 問題
・ボールオプションが機能しない
・正当な理由なしにコアダンプする場合があります
onworks.netサービスを使用してオンラインでgmx-viewを使用する
