これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-encseq-info です。
プログラム:
NAME
gt-encseq-info - エンコードされたシーケンスに関するメタ情報を表示します。
SYNOPSIS
gt エンセック info [オプション ...] インデックス名
DESCRIPTION
-nomap [はい|いいえ]
エンコードされたシーケンスをマップしません (提供される情報が少なくなります) (デフォルト: no)
-ミラーリングされた [はい|いいえ]
ミラーリングされたエンコードされたシーケンスを使用 (DNA のみ) (デフォルト: いいえ)
-noindexname [はい|いいえ]
インデックス名を出力しません (デフォルト: no)
-show_alphabet [はい|いいえ]
出力アルファベット定義 (デフォルト: no)
-n50 [はい|いいえ]
N50 値を表示 (少なくとも 50% をカバーするための最大シーケンスの最小長)
シーケンスの合計長) (デフォルト: no)
-o [ファイル名]
指定されたファイルに出力をリダイレクトします(デフォルト:未定義)
-gzip [はい|いいえ]
gzip圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)
-bzip2 [はい|いいえ]
bzip2圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)
-力 [はい|いいえ]
出力ファイルへの書き込みを強制します(デフォルト:no)
-助けて
ヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用して gt-encseq-info をオンラインで使用する