gt-seqfilter - クラウドでオンライン

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-seqfilter です。

プログラム:

NAME


gt-seqfilter - 指定されたシーケンス ファイルをフィルターし、結果を標準出力に表示します。

SYNOPSIS


gt 秒フィルター [オプション ...] [シーケンスファイル ...]

DESCRIPTION


-最小長 []
シーケンスがフィルターを通過するために必要な最小長を設定します (デフォルト: 未定義)

-最大長 []
シーケンスがフィルターを通過できる最大長を設定します (デフォルト: 未定義)

-maxseqnum []
フィルターを通過できるシーケンスの最大数を設定します (デフォルト: 未定義)

-サンプル []
各シーケンスがフィルターを通過する確率を設定します (デフォルト: 1.000000)

-ステップ []
毎回だけ 手順- 番目のシーケンスはフィルターを通過します (デフォルト: 1)

-ワイルドカード [はい|いいえ]
ワイルドカードを含むシーケンスを除外します (デフォルト: no)

-幅 []
FASTAシーケンス印刷の出力幅を設定します(0はフォーマットを無効にします)(デフォルト:0)

-o [ファイル名]
指定されたファイルに出力をリダイレクトします(デフォルト:未定義)

-gzip [はい|いいえ]
gzip圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)

-bzip2 [はい|いいえ]
bzip2圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)

-力 [はい|いいえ]
出力ファイルへの書き込みを強制します(デフォルト:no)

-助けて
ヘルプを表示して終了します

-バージョン
バージョン情報を表示して終了します

報告 バグ


バグを報告するgt-users@genometools.org>.

onworks.net サービスを使用して gt-seqfilter をオンラインで使用する



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