これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-seqfilter です。
プログラム:
NAME
gt-seqfilter - 指定されたシーケンス ファイルをフィルターし、結果を標準出力に表示します。
SYNOPSIS
gt 秒フィルター [オプション ...] [シーケンスファイル ...]
DESCRIPTION
-最小長 [値]
シーケンスがフィルターを通過するために必要な最小長を設定します (デフォルト: 未定義)
-最大長 [値]
シーケンスがフィルターを通過できる最大長を設定します (デフォルト: 未定義)
-maxseqnum [値]
フィルターを通過できるシーケンスの最大数を設定します (デフォルト: 未定義)
-サンプル [値]
各シーケンスがフィルターを通過する確率を設定します (デフォルト: 1.000000)
-ステップ [値]
毎回だけ 手順- 番目のシーケンスはフィルターを通過します (デフォルト: 1)
-ワイルドカード [はい|いいえ]
ワイルドカードを含むシーケンスを除外します (デフォルト: no)
-幅 [値]
FASTAシーケンス印刷の出力幅を設定します(0はフォーマットを無効にします)(デフォルト:0)
-o [ファイル名]
指定されたファイルに出力をリダイレクトします(デフォルト:未定義)
-gzip [はい|いいえ]
gzip圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)
-bzip2 [はい|いいえ]
bzip2圧縮出力ファイルの書き込み(デフォルト:no)
-力 [はい|いいえ]
出力ファイルへの書き込みを強制します(デフォルト:no)
-助けて
ヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告するgt-users@genometools.org>.
onworks.net サービスを使用して gt-seqfilter をオンラインで使用する