これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドLAmergeです。
プログラム:
NAME
LAmerge-.lasファイルを単一のソートされたファイルにマージします
SYNOPSIS
ラマージ [-v] マージ:las パーツ:las ...
DESCRIPTION
.lasファイルをマージします 部品 単一のソートされたファイルに マージ、ここで、
部品 ファイルはソートされます。 オペレーティングシステムの制限により、 部品 ファイル
<= 252である必要があります。 -v オプションを設定すると、プログラムは読み取られたレコードの数を報告します
と書かれています。
正しく使用され、 ラマージ と LAソート(1)一緒に「外部」ソートを実行できるようにする
これは、すべてのローカルを集約して含むソートされたファイルのコレクションを生成します
によって検出された配置 ダリナー(1)、それらの連結が次の順序でソートされるように
(a、b、o、ab)。 特に、これは、特定のa-readのすべての配置が
ファイルのXNUMXつで連続して見つかりました。 したがって、すべてを調べる必要がある計算
特定の読み取りのアライメントは、これらのソートされたファイルの単純な順次スキャンで機能します。
onworks.netサービスを使用してオンラインでLAmergeを使用する