これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド マッスルです。
プログラム：
NAME
筋肉 - 複数のタンパク質配列のアライメント
SYNOPSIS
筋肉 -に file （ファスト） [-でる 出力 file （デフォルト 速い）] [-診断] [-ログ ログ file]
[-マキターズ n] [-最大時間 n] [-maxmb m] [-html] [-msf] [-clw] [-clwstrict]
[-ログ[a] ログファイル] [-静かな] [-安定] [-グループ] [-バージョン]
DESCRIPTION
このマニュアルページでは、 筋肉
筋肉 タンパク質配列を整列させ、Clustal W よりも優れており、高速であると考えられています。
OPTIONS
-に file
FASTA 形式の入力ファイルへのパス
-でる 出力 file
出力ファイルへのパス、デフォルトで FASTA 形式
-診断
対角線を見つける (類似したシーケンスの場合は高速になります)
-マキターズ n
最大反復数 (整数、デフォルトは 16)
-最大時間 n
反復の最大時間 (時間単位) (デフォルトでは制限なし)
-maxmb m
割り当てる最大メモリ (MB 単位) (デフォルトは RAM の 80%)
-html
出力を HTML 形式で書き込みます (デフォルトは FASTA)
-msf
MSF 形式で出力を書き込みます (デフォルトは FASTA)
-clw
Clustal W 形式で出力を書き込みます (デフォルトは FASTA)
-clwstrict
-clw として、「CLUSTAL W (1.81)」ヘッダー付き
-ログ[a] ログファイル
ファイルへのログ (-loga の場合は追加、-log の場合は上書き)
-静かな
進行状況メッセージを標準エラー出力に書き込まないでください
-安定
入力順序でシーケンスを出力します (デフォルトは -group)
-グループ
シーケンスを類似性によってグループ化します (これがデフォルトです)
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
onworks.net サービスを使用してオンラインで Muscle を使用する
