これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド sim2gff です。
プログラム:
NAME
sim2gff - SIM ファイルを GFF 形式のレコードに変換する
SYNOPSIS
sim2gff [-frxyHh] sim_file > gff_file
DESCRIPTION
このマニュアルページでは、 sim2gff
sim2gff SIMファイルをGFF形式のレコードに変換するPerlで書かれたプログラムです
(gff2aplot および gff2javaplot で使用するため)。
OPTIONS
-NS、 - 助けて
オプションの概要を表示します。
-f 出力は次の名前のファイルに書き込まれます.gff.
-r シーケンスの順序を交換します (y 軸の Seq1、x 軸の Seq2)。
-x
種1には種名を指定します(デフォルト:「Seq1」)。
-y
種2には種名を指定します(デフォルト:「Seq2」)。
-H 種のラベルには fasta ファイル ヘッダーを使用します。
EXIT ステータス
以下の perl ライクな終了ステータスが返されます:
0 エラー
1 正常終了
onworks.net サービスを使用してオンラインで sim2gff を使用する