これは 123NGS という名前の Linux アプリで、最新リリースは 123Fastq_v1.1.rar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
123NGS with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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123NGS
DESCRIPTION
123Fastq は、123NGS ファミリの最初のメンバーとして、オープンソース ツールの分野でこれまでよりも簡単に、次世代シーケンシング リード (FASTQ ファイル) に関するすべての前処理を実行します。クイックユーザーマニュアルをダウンロード:
http://bit.ly/36uoA2C
この作品は以下の監督の下で行われました。
Javad Zahiri 博士、バイオインフォマティクスおよび計算オミクス研究室 (BioCOOL)
と
マスード・ガルシャスビ博士、イラン、テヘランのタルビアト・モダレス大学医科学部医療遺伝学科。
特徴
- 次世代シーケンシングリードの品質チェック
- ペアエンドリードの品質チェック
- 柔軟なトリマー
- 品質チェック結果に基づいたトリム推奨事項
- XNUMX つのアプローチによるアダプターの汚染除去
- Fast5 から FASTQ への変換
- SAM/BAM から FASTQ への変換
- FASTQ 読み取りの逆多重化
- クロスプラットフォーム (UNIX、Windows)
- Javaで書かれています
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java
これは、https://sourceforge.net/projects/project-123ngs/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
