これは、オンライン Linux で実行する CRISPR-Offinder という名前の Linux アプリで、最新リリースは CRISPR-offinder-1.0.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
CRISPR-Offinder という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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オンラインの Linux で実行する CRISPR-Offinder
DESCRIPTION
要約: 効率的で特異的な CRISPR スモール ガイド RNA (sgRNA) を設計することは、CRISPR テクノロジーの応用を成功させるための鍵の XNUMX つです。 重要なことは、異なるプロトスペーサー隣接モチーフ (PAM) を持つ新しい RNA 誘導型エンドヌクレアーゼがますます発見されていることです。 したがって、さまざまな RNA 誘導 DNA エンドヌクレアーゼの要件を満たす sgRNA を設計するための汎用ツールを開発することが緊急に必要とされています。 この目的を達成するために、「CRISPR-offinder」という名前の柔軟な sgRNA 設計プログラムが開発されました。 この新しいプログラムの最も重要な機能は、既知のすべての PAM タイプと顧客定義の PAM をサポートしていることです。 さらに、CRISPR-offinder は、オフターゲット部位の数によってゲノム内の候補 sgRNA を見つけてランク付けすることができ、また、単一またはペアの gRNA を設計するために使用することもできます。 CRISPR-offinder はコマンドライン プログラムとして無料で入手できるほか、当社の Web サイトからアクセスできます。入手可能性: CRISPR-offinder は以下から無料で入手できます。 http://crispr-offinder.com/ or http://crispr.igenetech.com/.
これは、https://sourceforge.net/projects/crispr-offinder/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
