これはEigenMSという名前のLinuxアプリで、最新リリースはEigenMS.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
EigenMSという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
固有MS
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DESCRIPTION
EigenMSは、R（およびMatlabの古いバージョン）で実装された正規化メソッドであり、シーケンスで使用する必要があるXNUMXつの関数のセットとして使用できます。
EigenMS.zipファイル（最新バージョン）をダウンロードしてください。
2017年XNUMX月にアップロードされた最新バージョンには、単一治療群の正規化のバグ修正があります。
2015年から再スケーリングは省略されています。
EigenMSは、SVDを利用してデータのバイアス傾向を検出し、それらを排除します。 EigenMSは、既知および未知の要因による影響を排除し、あらゆる-omicプラットフォームに利用できます。
次のXNUMXつの論文で、LC-MS / MSおよびメタボロミクスにおけるその有用性を示しました。
1）PMID：19602524。「特異値分解を使用したボトムアップMSベースのプロテオミクスにおけるピーク強度の正規化」。
Karpievitch YV、Taverner T、Adkins JN、Callister SJ、Anderson GA、Smith RD、Dabney AR
バイオインフォマティクス2009
2）「EigenMSによるメタボロミクスデータの正規化」
Karpievitch YV、Nikolic SB、Wilson R、Sharman JE、Edwards LM
PLoS ワン 2014
Audience
科学/研究
プログラミング言語
MATLAB、S / R
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/eigenms/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
