これは FastQC という名前の Linux アプリで、最新リリースは v0.12.1sourcecode.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
FastQC withOnWorksという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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高速QC
DESCRIPTION
FastQCは、ハイスループットシーケンスデータセットの潜在的な問題を特定するために設計された品質管理分析ツールです。 その目標は、ハイスループットシーケンスパイプラインからの生のシーケンスデータの品質をチェックする簡単な方法を提供することです。 これは、fastqまたはbam形式のXNUMXつ以上の生のシーケンスファイルに対してモジュラーセットの分析を実行することによって行われます。 次に、結果を要約し、ライブラリが異常に見える可能性のある領域を強調表示するレポートを作成します。 これにより、データに問題がある可能性のある場所に移動し、さらに分析を行う前に、データを修正するために必要な手順を実行できるようになります。
FastQCは、特定のタイプのシーケンス手法に関連付けられていないため、さまざまな実験タイプ（Genomic Sequencing、ChIP-Seq、RNA-Seq、BS-Seqなど）のライブラリを調べるために使用できます。
特徴
- BAM、SAM、またはFastQファイルからデータをインポートします
- 潜在的な問題領域を強調する簡単な概要を提供します
- データを迅速に評価するための要約グラフと表
- 結果をHTMLにエクスポート
- オフラインで使用できます
プログラミング言語
Java
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
