Linux 用の一般化パターン マッチングのダウンロード

これは、Generalized Pattern Matching という名前の Linux アプリで、最新リリースは longpattern.exe としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。

 
 

Generalized Pattern Matching with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。

このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。

-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。

--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。

-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。

-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。

-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。

-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。

一般化されたパターン マッチング



説明：

このツールは、サブパターン間のギャップを無視して、サブパターンのセットのみを見つける一般化されたパターン マッチング問題を解決するように設計されています。 このツールは非常に高速であり、エラーに対する耐性も優れています。



特徴

  • ヒトゲノムのパターンマッチングをXNUMX分以内に実行
  • ハードディスクベースのk-mersインデックス
  • 補完的なデュアルシーディング
  • 拡張時にプルーニングされた DP
  • シード長 k が短いため、誤差に対する耐性が良好です
  • 正のギャップと負のギャップの両方を処理できます


Audience

上級エンドユーザー


ユーザーインターフェース

コマンドライン


プログラミング言語

C


データベース環境

その他のAPI



カテゴリー

バイオインフォマティクス

これは、https://sourceforge.net/projects/gpatternmatch/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。

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