これは GEPETTO - Gene Prioritization in Java という名前の Linux アプリで、最新リリースは README.txt としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
GEPETTO - Gene Prioritization in Java with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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GEPETTO - Java における遺伝子の優先順位付け
DESCRIPTION
GEPETTO (GEne PrioriTization ExTended TOol) は、個人データの機密性を確保するデスクトップ コンピューター上で遺伝子の選択と優先順位付けを行うためのオリジナルのオープンソース フレームワークで、LGPL ライセンスに基づいて配布されています。 SM2PH-Central Framework (KD4v、MSV3d、BIRD など) のデータ統合機能を社内で開発された遺伝子優先順位付け手法と組み合わせて利用します。 現在、遺伝子配列、タンパク質間相互作用、遺伝子発現、病気の原因となる確率、ゲノムの状況に基づいた XNUMX つの優先順位付けモジュールが組み込まれています。
GEPETTO は Java/Python で書かれており、高度なモジュラー アーキテクチャによってサポートされています。つまり、代替のスコアリング方法や新しいデータ ソースを含めるために、ユーザーが簡単に変更および拡張できます。 私たちは、MSV3D データベースのバリアント データを活用することで、システムを遺伝子レベルからバリアント レベルの優先順位付けに拡張する予定です。
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Audience
科学/研究、教育、開発者
ユーザーインターフェース
Webベース、コンソール/ターミナル、コマンドライン
プログラミング言語
Python、Java、S / R
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/gepetto/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
