これはGrinderという名前のLinuxアプリで、最新リリースはGrinder-0.5.4.tar.gzとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Grinder withOnWorksという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
グラインダー
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DESCRIPTION
グラインダーは、すべての主要なシーケンスプラットフォーム用にシミュレートされたオミックショットガンおよびアンプリコンシーケンスライブラリを作成するための多用途のオープンソースバイオインフォマティクスツールです。
特徴
- ショットガンまたはアンプリコン（例：16S rRNA）ライブラリーの読み取り
- ゲノム、トランスクリプトミクス、プロテオミクス、メタゲノム、メタトランスクリプトミクス、またはメタプロテオミクスのデータセットを生成するためのオミクスサポート
- 任意の読み取り長の分布と読み取り数
- PCRおよびシーケンシングエラーのシミュレーション（キメラ、点突然変異、ホモポリマー）
- ペアエンド（メイトペア）データセットのサポート
- 特定のランクアバンダンス設定、または各ゲノム、遺伝子、またはタンパク質に対して手動で与えられたアバンダンス
- 与えられた豊かさ（アルファ多様性）を持つデータセットの作成
- 関連するデータセットは、可変数のゲノムを共有できます（ベータ多様性）
- ゲノムの長さや遺伝子のコピー数を変えることによって生じるバイアスのモデリング
- 優先オプションを保存するプロファイルメカニズム
- GUI、CLI、APIなどの複数のインターフェースを介して生物学者またはパワーユーザーが利用できます
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル
プログラミング言語
パール
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/biogrinder/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
