これはMAGeCKという名前のLinuxアプリで、最新リリースはbroadgpp-brunello-library-corrected.txt.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
オンラインでMAGeCKという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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マジク
DESCRIPTION
ゲノムワイドCRISPR-Cas9ノックアウト（MAGeCK）のモデルベースの分析は、最近のゲノムスケールのCRISPR-Cas9ノックアウトスクリーン技術から重要な遺伝子を特定するための計算ツールです。
手順とドキュメントについては、wikiページを参照してください。
MAGeCKは、Dana-Farber Cancer Institute / Harvard School of PublicHealthのDr.Xiaole ShirleyLiuの研究室のWeiLiとHanXuによって開発され、Children's National MedicalCenterのWeiLi研究室によって維持されています。 MAGeCKを開発するための革新的な基礎がん研究におけるClaudiaAdamsBarrプログラムとNIH / NHGRIからのサポートに感謝します。
特徴
- スクリーニング分析で最も一般的な計算アルゴリズム
- 400以上の引用と60kのダウンロード
- ゲノムワイドなCRISPR-Cas9ノックアウト実験で遺伝子をスクリーニングするためのシンプルで使いやすいパイプライン
- 開始が簡単なチュートリアルを含む完全なドキュメント
- 高感度と低誤検出率
- 新機能とバグ修正でソースコードを積極的に維持する
- 開発者およびユーザーコミュニティからのサポート
- 出版物の標準図を生成する一連の視覚化機能
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Python、C
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/mageck/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
