これは MiModD という名前の Linux アプリで、最新リリースは MiModD-0.1.9.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
MiModD with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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ミモッド
DESCRIPTION
MiModDは、システムリソースの最適化された使用法とユーザーフレンドリーなインターフェイスを備えた、次世代シーケンシング（NGS）データからのゲノムバリアント識別のためのソフトウェアパッケージです。 ほとんどのモデル生物ゲノムでは、ユーザーは、アラインされていないゲノムNGS読み取りデータから、通常のデスクトップPC上のバリアントの注釈付きリストまで、数時間以内に完全な分析を実行できます。 そのユーザーインターフェースは初心者にやさしく、訓練を受けたバイオインフォマティクスの助けを借りずに遺伝学者がNGSデータを自分で分析することを奨励するように設計されています。
特徴
- 単一のPCやノートブックでもモデル生物ゲノムのWGS分析
- バリアントのフィルタリングとマッピングのための強力なツール
- 単一のコマンドで既存のGalaxyインストールに統合
- テスト用のサンプルデータセット
- オンラインチュートリアルと広範なドキュメント
- プラットフォーム固有のバンドルされたディストリビューション（多くのLinuxフレーバー、OS X）は、インストールせずに事前構成されたGalaxyインスタンスで実行およびテストします
Audience
科学/研究、上級エンドユーザー
ユーザーインターフェース
Webベースのコマンドライン
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/mimodd/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
