これは、オンラインの Linux で実行する olego という名前の Linux アプリで、最新リリースは olego.src.v1.1.6.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
olego という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
オンラインの Linux で実行する olego
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DESCRIPTION
OLego は、mRNA-seq リードの de novo スプライシング マッピング用に特別に設計されたプログラムです。 OLego はシードおよび拡張スキームを採用しており、別個の外部マッパーに依存しません。 非常に小さなシード (12 ～ 14 nt) を使用し、Burrows-Wheeler 変換 (BWT) と FM インデックスを使用して効率的にマップされたジャンクション検出の高感度を実現します。 これにより、小さなエクソンを検出する際に特に感度が高くなります。 マルチ スレッドを完全にサポートする C++ で実装されているため、大規模なデータを高速に処理できます。Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C ++、C
これは、https://sourceforge.net/projects/ngs-olego/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
