これは PF_HP という名前の Linux アプリで、最新リリースは README.txt としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して、PF_HP という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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PF_HP
DESCRIPTION
単純化された二次元 HP モデル (疎水性/極性) においても、タンパク質の折り畳みの予測は NP 完全です。 HP シーケンス (0 ~ 1 ビット文字列) の短い入力を解決するために、シリアルおよびパラレル実行によるブルート フォース アルゴリズムを実装します。
Selbst im vereinfachten zweidimensionen HP-Modell(疎水性/極性)は、ProteinfaltungがNP-vollständigになります。 上位の実装者は、ProteinfaltungのブルートフォースAlgorithmszurLösungkurzerEingabesequenzen(0-1-Bitstrings)です。
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Paypal:paypal.me/GerritLeder
共通金貨
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プリンシパルインベスティゲーター
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Gerrit Leder: タンパク質折り畳みアルゴリズムの設計とテスト、およびエッフェルでの初期実装。
エッフェルコンサルタント
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Finnian Reilly: Eiffel コードの最適化と並列処理の適応。
www.hex11software.com
エッフェル ハイフン ループ ドットコムのフィニアン
特徴
- コマンドラインフラグ -pf2_mt を使用した並列計算
- デフォルトは 4 スレッドですが、スイッチ -threads ... でカスタマイズできます。
- コマンドラインフラグ -sequence を使用したカスタム 0-1-ビット文字列 ...
- コマンドラインフラグ -pf2 を使用したシリアルアルゴリズム
- To-Do: pf3 および pf3_mt のバグ修正、S、R、L 方向の実装
- To-Do: lib EL を void セーフにする
- To-Do: CLI および IDE での単体テスト
Audience
ヘルスケア産業、科学/研究、教育
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル
プログラミング言語
エッフェル
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/pfhp/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。