これは raxmlGUI という名前の Linux アプリで、最新リリースは raxmlGUI1.5b3.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して、raxmlGUI という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
Ad
raxmlGUI
DESCRIPTION
リリースノート: 新しいプロジェクトの場所で raxmlGUI 2.0 を入手します。 https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/raxmlGUI は、最尤法を使用した系統推論に最も人気があり広く使用されているソフトウェアの XNUMX つである RAxML へのグラフィカル ユーザー インターフェイスです。
RAxML を使用した系統解析用の使いやすいグラフィカル フロントエンド (Stamatakis、2006)。 引用してください: Silvestro, Michalak (2012) - raxmlGUI: RAxML のグラフィカル フロントエンド。 生物の多様性と進化 12、335-337。 DOI: 10.1007/s13127-011-0056-0
特徴
- *新しいバージョン 2.0 が利用可能になりました: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/*
- *バージョン 1.5* では、CIPRES Science Gateway を介して分析を実行する可能性が追加されています
- GUI には RAxML 実行可能ファイルが含まれています
- マルチプラットフォーム互換性 (Mac OS、Windows、Linux)
- Python 2.6、2.7が必要です
- データのパーティショニングとアウトグループ選択のための直感的なインターフェイス
- DNA、アミノ酸、バイナリ、およびマルチステート アラインメントのモデル選択
- NEXUS から PHYLIP (またはその逆) への自動変換
- FASTA ファイルをインポートする
- 祖先の状態の再構築
- 「ブートストップ」機能 (Pattengale et al. 2010)
- サイトの対話型除外
- 複数のアライメントと自動パーティショニングを組み合わせる
- トポロジー制約の対話型定義
- ロビンソン・フォールズのペアワイズ距離
- サイトごとの可能性
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
Tk
プログラミング言語
Python
これは、https://sourceforge.net/projects/raxmlgui/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
