これは Subread という名前の Linux アプリで、その最新リリースは subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
Subread with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
サブリード
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DESCRIPTION
Subread ソフトウェア パッケージは、次世代シーケンス データを処理するためのツール キットです。 これには、Subread アライナー、Subjunc エクソン-エクソン結合検出器、および featureCounts リード要約プログラムが含まれます。
サブリード アライナーは、gDNA-seq リードと RNA-seq リードの両方をアライメントするために使用できます。 Subjunc aligner は、エクソン-エクソン結合の検出用に設計されたものです。 RNA-seq リードのマッピングでは、Subread はローカル アライメントを実行し、Subjunc はグローバル アライメントを実行します。 Subread と Subjunc は、Yang Liao、Gordon K Smyth、Wei Shi の論文に掲載されました。 「サブリード アライナー: シードアンド投票による高速、正確、スケーラブルなリード マッピング」、Nucleic Acids Research、2013、41(10):e108
特徴
- 読み取りアライナー
- 次世代シーケンシング
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/subread/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
