これはSW＃という名前のLinuxアプリで、最新リリースはswsharp-src.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
SW＃という名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
SW＃
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DESCRIPTION
SW＃（swsharp）は、CUDA対応のGPUに基づくシーケンスアラインメント用のライブラリです。 これは、HirschbergsおよびUkkonensアルゴリズムを利用して、メモリ効率と追加の高速化を実現します。 ライブラリは、複数のGPUで使用するためにスケーラブルです。 ライブラリの一部は、CUDA対応クラスターにMPIを利用します。この作業は、プロジェクトUIP-11-2013-7353の下でCroatian ScienceFoundationによって部分的にサポートされています。
データベース検索が利用可能になりました！
出版物：
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
関連作業：
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
NEW：
SW＃Web版：
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
これは、https：//sourceforge.net/projects/swsharp/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
