これはTVscriptという名前のLinuxアプリで、最新リリースはtvscript.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksでTVscriptという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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テレビスクリプト
DESCRIPTION
TVscriptは、ユーザーが指定したしきい値よりも大きい条件内読み取りカウントの変動に関連するトランスクリプトの削除をユーザーが調査できるように設計されたツールです。 更新されたカウントファイルのセットは、そのようなトランスクリプトが存在しない元の入力データから生成されます。 これらの更新されたカウントファイルは、その後、例えば、差次的に発現された転写物の同定において、下流の分析内で使用することができる。 後者の場合、条件内の変動の程度は、このタスク用に設計されたさまざまなソフトウェア間で、あいまいに、一貫性のない、識別された遺伝子の最終リストに影響を与えます。 さまざまなしきい値でこのような変動を除去することの効果を調査できることで、差次的発現分析とそのようなデータを使用する他の研究分野の両方に関連する直感的な洞察が得られます。 完全な詳細、およびイヌ科の家畜化に関連するトランスクリプトミクスデータを含むXNUMXつのケーススタディは、私たちの論文で利用可能です：リンクはまもなく利用可能になります。
特徴
- RNA-seqデータセット全体の条件内変動の影響の調査
- ダウンロードフォルダ内の完全なテストデータの例
- 実行可能jarファイル、任意のプラットフォームで実行
- インストールが簡単で、フォルダを解凍するだけです
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/tvscript/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
