これは、オンライン Linux で実行する VCF Explorer という名前の Linux アプリで、最新リリースは VCFExplorer.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
VCF Explorer という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行できる VCF Explorer
DESCRIPTION
コストの削減されたハイスループット技術は、何千もの全ゲノムからなる多くのシーケンスプロジェクトにつながりました。 エクソームから全ゲノムへのパラダイムシフトは、出力ファイルのサイズを大幅に増加させます。 エクソームファイルを分析するために開発された既存のツールのほとんどは、全ゲノム研究によって生成された大きなVCFファイルには適切ではありません。 この作業では、大きなファイルを処理できるバリアント分析ソフトウェアであるVCF-Explorerを紹介します。 プログラムの効率的なメモリ管理と予備的な解析ステップの排除により、通常のコンピュータで分析を実行できます。 VCF-Explorerは、注釈とサンプルに対するさまざまなタイプのクエリを定義できる使いやすい環境を提供します。 VCF-Explorerは、標準のラップトップから高度なサーバーに至るまで、さまざまな環境や計算プラットフォームで実行できます。特徴
- 使いやすい環境
- 効率的なメモリ管理
- 大規模な（全ゲノム）VCFファイル処理
- 計算資源が限られたパソコンで操作可能
ユーザーインターフェース
Qt
プログラミング言語
C ++、C
これは、https：//sourceforge.net/projects/vcfexplorer/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
