これはVirmidという名前のLinuxアプリで、最新リリースはVirmid-1.2.0.tar.gzとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Virmidという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
Ad
ヴァーミッド
DESCRIPTION
ニュース：
11年07月2013日新しいバージョンのVirmid1.1.0がアップロードされました。
08年29月2013日Virmidの論文がGenomeBiologyに掲載されました。
Kim S et al、「Virmid：サンプル不純物推定による体細胞変異の正確な検出」、Genome Biology 2013、14：R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid（SNP呼び出し用の仮想顕微解剖）は、疾病管理が一致するサンプル用に設計されたJavaベースのバリアント呼び出し元です。 Virmidは、病気のサンプルを十分に精製できない個々の汚染の可能性を特定することも専門としています。 SNPの呼び出し率はこの不均一性によって大幅に損なわれますが、Virmidは、汚染レベル（アルファ）を考慮することにより、対立遺伝子頻度の低いSNPを発見できます。 Virmidの重要な機能は次のとおりです。
•（混合）疾患サンプルにおける対照サンプルの正確な伝播の推定
•推定比率に関して改善されたSNPおよび体細胞変異の呼び出し
特徴
- 体細胞変異の発見
- サンプル不純物の推定
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Java
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/virmid/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
