これは Altrans という名前の Windows アプリで、最新リリースは altrans.v1.1.02.windows.x86.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Altrans with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
アルトランス
説明：
Altrans は、スプライシング イベントを相対的に定量化する方法です。 これには、RNA-seq 実験からの BAM アライメント ファイルと、ゲノム内のエクソンの位置を詳細に記述した GTF 形式のアノテーション ファイルが必要です。 XNUMX つのメイトが XNUMX つのエクソンにマッピングされ、もう XNUMX つのメイトが異なるエクソンにマッピングされるペアエンドリードや、エクソンのエクソンジャンクションにまたがるスプリットリードを使用して、XNUMX つのエクソン間の「リンク」をカウントします。 重複するエクソンがある場合、これらは「エクソン グループ」にグループ化され、エクソン グループ内の各エクソンの固有の部分が特定され、リードをエクソンに割り当てるときに使用されます。 固有の領域から確認されたリンク数は、リンク カバレッジと呼ばれる挿入サイズの分布を考慮して、そのようなリンクが観察される確率で正規化されます。 最後に、生成される定量的メトリックは、最初の最初のエクソンが作成するすべてのリンクのカバレッジの合計に対する XNUMX つのリンクのカバレッジの割合です。
Audience
科学/研究
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/altrans/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。