これは AutoDockParser という名前の Windows アプリで、最新リリースは AutodockParser.exe としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
AutoDockParser という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
AutoDockParser
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DESCRIPTION
AutoDock Suite は、分子ドッキングと仮想スクリーニングを実行するための最も人気のあるソフトウェアの XNUMX つです。 このスーツには、AutoDock と AutoDock Vina の XNUMX つのプログラムが用意されています。 AutoDock は出力をドッキング ログ ファイル (DLG ファイル) として提供しますが、後者は pdbqt 形式で出力します。
これらの結果の後処理は長い間手作業で行われてきたため、ユーザー固有のさまざまなプロトコルやワークフローが設計されています。 その後の相互作用分析のためにこれらの結果を手動で処理することは、時間がかかり、一見平凡な作業のままです。 手動処理には、さまざまな外部ソフトウェアへの依存が含まれます。
AutoDock Parser は、AutoDock Suite から取得したドッキング結果の自動後処理を提供します。 AutoDock Parser は、ドッキング結果の後処理の労力を最小限に抑えることを目的とした使いやすいツールです。 これにより、ユーザーは XNUMX ステップで入力 DLG/PDBQT ファイルからタンパク質-リガンド複合体を作成できます。
これは、https://sourceforge.net/projects/autodockparser/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
