これは Dress Up RNA seq という名前の Windows アプリで、最新リリースは DressUp.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Dress Up RNA seq with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショット：
ドレスアップRNAシーケンス
説明：
DressUp の目的は、Illumina シーケンサーからのデータ分析のすべてのステップが HPC 環境で XNUMX つのステップで実行される、エンドツーエンドの RNA seq パイプラインを作成することです。 含まれる RNA シーケンス プログラムには、TopHat、CuffLinks、CuffDiff、CuffMerge、FastQC、および FastX ツールキットを使用したトリミングが含まれます。
DressUp は、さまざまなパッケージを単一のスクリプトに合理化することで、RNA シーケンス プログラムを容易にします。 このスクリプトは、バッチ クラスター システム上で RNA seq プログラムを実行します。 スクリプトを実行すると、構成ファイルに設定された属性に応じてジョブがクラスターに送信されます。
プログラム オプションはメイン スクリプト「DressUp」で変更でき、PBS オプションは HeaderFiles ディレクトリから変更できます。
特徴
- CuffMerge、FastX トリミング、および FastQC は設定ファイルからオンまたはオフにできます
- パイプラインのコンポーネントごとに個別の PBS スクリプトが利用可能
- 複数の RNA シーケンス プログラムを XNUMX つのステップで実行
- 各プログラムの PBS オプションを調整する機能
Audience
科学/研究
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/dressuprnaseq/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。