これは FUNseq という名前の Windows アプリで、その最新リリースは ProcessStack2D.exe としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
FUNseq with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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DESCRIPTION
このページでは、FUNseq パイプラインのセル セグメンテーション/トラッキング プログラムを示します。
攻撃的な表現型 (侵襲的遊走、多極分裂、非対称系統発生など) に基づいて、大規模な異種集団から癌細胞のまばらなサブセットを特定することは困難です。 また、これらの特徴を示す細胞は予後不良と直線的に相関するため、このような異常の同定は重要です。 私たちのグループでは、これらのまばらで異常ながん細胞を捕捉するためのハイスループットスクリーニング顕微鏡が開発されました。 これらの目的の細胞を正確かつ迅速に識別するためのプログラムが不可欠です。 このために、高スループット画像の細胞を追跡し、攻撃的な表現型を決定する mTGMM プログラムを開発しました。
特徴
- 画像の前処理: 細胞間の蛍光強度プロファイルが不均一な画像の品質を調整する方法を提供します
- 並列核セグメンテーション: 細胞セグメンテーションに凝集流域を使用しました
- ガウス モデルを使用した追跡: 原子核の強度プロファイルは、2D ガウス分布としてモデル化されます。 原子核の追跡は、原子核の位置、形状、全体的な強度が 1 つの連続する時間ポイント間で劇的に変化することはないというアプリオリな知識を使用して、ベイジアン推論を使用して時点 t から (t + XNUMX) までのすべてのガウス分布を転送することによって行われます。
- 特徴抽出: これは、細胞移動、分裂、および細胞内強度の記録を含む特徴テーブルを生成する事後分析です。
- データの視覚化: セル マスク、移動軌跡、細胞分裂、形態検出を視覚化するオプションを提供します。
これは https://sourceforge.net/projects/funseq/ からも取得できるアプリケーションです。 これは、OnWorks でホストされており、無料のオペレーティング システムの XNUMX つからオンラインで簡単に実行できます。
