これは、High-Throughput Tabular Data Processor という名前の Windows アプリで、Linux オンライン上で Windows オンラインで実行されます。最新リリースは HTDP.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
High-Throughput Tabular Data Processor という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用してオンライン Linux 上で Windows 上で無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショット：
オンライン Linux 上で Windows オンラインで実行できる高スループット表形式データ プロセッサ
説明：
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR（HTDP）は、超並列シーケンスやマイクロアレイなどのハイスループットテクノロジーから生じる大きなテキストファイルのデータ探索と削減タスクを容易にすることを目的としたJavaアプリケーションです。 このソフトウェアは、マイクロアレイおよびディープパラレルシーケンスデータ用に最適化されていますが、文字で区切られた表形式のデータセットを受け入れることができます。 HTDPは、Variant Call Format（VCF）ファイルバージョンをインポート、処理、および変換することもできます。 4.0、4.1および4.2（http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).HTDPはクイックフィルタリング機能を提供し、単一または複数の入力ファイルで構成されるデータを処理できます。
引用：Madanecki P、BałutM、Buckley PG、Ochocka JR、Bartoszewski R、CrossmanDKなど。 （2018）ハイスループット表形式データプロセッサ–大規模なデータセットを処理するためのプラットフォームに依存しないグラフィカルツール。 PLoS ONE 13（2）：e0192858。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
特徴
- 文字で区切られた列データ（BED、GFF、GTF、WIG、VCFなど）で機能します
- 表形式のデータファイルを垂直方向と水平方向にマージします
- ゲノム位置または共通列を使用して表形式のデータファイルをマージします
- 無制限のフィルタリングおよびデータ削減機能
- フォーマットとコンテンツに関するさまざまなファイルを同時に分析できます
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/htdp/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。