これは、TomoJ という名前の Windows アプリで、最新リリースは TomJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependency.jar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
TomoJという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
トモジ
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DESCRIPTION
TomoJは、トモグラフィック再構成用のImageJプラグインです。
電子断層撮影用に設計されていますが、平行ビームによる取得はすべて機能するはずです。
TomoJは、3D再構成(WBP、ART、SIRT、OS-SART、圧縮センシング)の前に傾斜シリーズの前処理と登録を提案します。
TomoJはJavaで記述されており、計算はマルチスレッド化されており、CPUまたはGPU(OpenCL)で再構築を実行できます。
登録については、次のように説明されています。
Journal of Structural Biology:X。2020、Volume4。「電子断層撮影のためのマーカーフリー画像アライメントの改善」COSSorzano etal。 https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMCバイオインフォマティクス。 2009年27月10日; 124:XNUMX。「電子断層撮影傾斜シリーズのマーカーフリー画像レジストレーション。」 COS Sorzano etal。
再構築の部分は次のように説明されています。
BMCバイオインフォマティクス。 2007年6月8日; 288:XNUMX。 「TomoJ:透過型電子顕微鏡法におけるXNUMX次元再構成のための断層撮影ソフトウェア。」MessaoudiC et al
特徴
- トモグラフィー
- 画像J
- チルトシリーズの位置合わせ
- 3D再構成
- WBP
- ART
- サート
- 圧縮センシング
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java、OpenCL
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/tomoj/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。