Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 bowtie2-inspect 명령입니다.
프로그램:
이름
bowtie2-inspect - bowtie2-inspect-* 인덱스용 래퍼
개요
bowtie2 검사 [옵션]*
기술
Ben Langmead의 Bowtie 2 버전 2.2.6([이메일 보호], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 파일 이름 - 후행 .1.bt2/.2.bt2
기본적으로 인덱싱된 뉴클레오티드 시퀀스의 FASTA 레코드를 표준으로 인쇄합니다.
밖. 와 함께 -n, 이름만 인쇄합니다. 와 함께 -s, 인덱스 요약만 출력
매개변수 및 시퀀스. 와 함께 -e, 해당하는 경우 색상을 유지합니다.
옵션
--큰 인덱스
'작은' 인덱스가 있더라도 '큰' 인덱스를 강제로 검사합니다.
-a/--건너서
FASTA 출력의 전체 문자 수(기본값: 60)
-n//-이름
참조 시퀀스 이름만 인쇄
-s/--요약
인쇄 요약 포함. 참조 이름, 길이, 인덱스 속성
-e/--bt2-ref
.bt2에서 참조 재구성(느림, 색상 유지)
-v/--말 수가 많은
자세한 출력(디버깅용)
-h/--돕다
도구 및 해당 옵션에 대한 자세한 설명 인쇄
--도움 이 사용 메시지를 인쇄하십시오
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 bowtie2-inspect 사용
