Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 cdbyank 명령입니다.
프로그램:
이름
cdbyank - cdbfasta로 생성된 인덱스 파일을 쿼리합니다.
기술
용법:
cdbank [-디 ] [-ㅏ |-n|-l|-s]
[-영형 ] [-q |-Q][-F] [-R] [-P] [-x] [-w] [-z
이전에 cdbfasta로 생성된 인덱스 파일입니다.
(보통 ".cidx" 접미사가 붙음)
-a fasta 레코드의 시퀀스 이름(접속)은 다음과 같습니다.
검색됨; 제공되지 않으면 stdin에서 액세스 목록이 예상됩니다.
-d 레코드를 가져올 fasta 파일입니다.
지정하지 않으면 cdbyank는 동일한 디렉토리에서 찾습니다.
이름은 같지만 ".cidx" 접미사가 없는 파일에 대해 상주합니다.
-o 발견된 기록은 파일에 기록됩니다. 표준 출력 대신
-x 색인이 생성된 경우 키당 여러 레코드를 검색할 수 있습니다.
데이터베이스에 동일한 키(고유 키가 아님)를 가진 레코드가 있습니다. (없이 -x 오직 하나
특정 키에 대한 기록이 검색됩니다.)
-i 대소문자를 구분하지 않는 쿼리(예상 있었다
cdbfasta로 생성됨 -i 선택권)
-Q 앞에 문자 '%'로 둘러싸인 쿼리 키를 출력합니다.
해당 기록
-q 동일 -Q 하지만 문자를 사용 대신에 '%'
-w 키를 찾을 수 없는 경우 경고 활성화(stderr로 전송)
-F 각 레코드에 대한 정의만 가져옵니다(시퀀스 폐기).
-P 내의 위치(파일 오프셋)만 표시합니다.
요청된 레코드에 대한 데이터베이스 파일
-R 시퀀스 범위 추출: 입력을 예상합니다. 갖다
형식: ' ' 그리고 지정된 시퀀스 범위만 가져옵니다.
-z 전체 파일의 압축을 푼다
('-z' 옵션과 함께 cdbfasta를 사용하여 빌드되었다고 가정)
-v 버전 번호 표시 및 종료
인덱스 파일 통계(데이터베이스 파일 필요 없음): -n 레코드 수를 표시
색인 -l 저장된 모든 키를 나열합니다. -s 인덱싱 요약 정보 표시
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 cdbyank를 사용하세요.
