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gdcm2vtk - 클라우드의 온라인

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터를 통해 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 gdcm2vtk 실행

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 gdcm2vtk 명령입니다.

프로그램:

이름


gdcm2vtk - VTK에서 지원하는 파일을 DICOM으로 변환합니다.

개요


gdcm2vtk [옵션] 파일 입력 파일 출력

기술


이 어플리케이션에는 XNUMXµm 및 XNUMXµm 파장에서 최대 XNUMXW의 평균 출력을 제공하는 gdcm2vtk VTK에서 지원하는 모든 파일(DICOM 파일 포함)을 입력으로 사용하고
DICOM 파일을 출력으로 생성합니다.

매개 변수


file-in 입력 파일 이름(DICOM 또는 VTK 지원)

file-out 출력 파일 이름(DICOM 또는 VTK 지원)

옵션


구체적인 옵션
--force-rescale 강제로 크기를 조정합니다.
--force-spacing 강제 간격.
--palette-color가 지원되는 경우 PALETTE COLOR 파일을 생성합니다.
--argb가 지원되는 경우 ARGB 파일을 생성합니다.
--compress(지원되는 경우)는 압축 파일을 생성합니다.
--use-vtkdicom vtkDICOMImageReader(GDCM 대신)를 사용합니다.
--modality는 양식을 설정합니다.
--lower-left 왼쪽 하단을 설정합니다.
--shift 시프트를 설정합니다.
--스케일 세트 스케일.
--compress 세트 압축(MetaIO).
-T --study-uid 연구 UID.
-S --series-uid 시리즈 UID.
--root-uid 루트 UID.

압축 옵션
-J --jpeg 이미지를 jpeg로 압축합니다.
-K --j2k 이미지를 j2k로 압축합니다.
-L --jpegls 이미지를 jpeg-ls로 압축합니다.
-R --rle 이미지를 rle로 압축합니다(무손실 전용).

일반 옵션
-h --도움말
이 도움말 텍스트를 인쇄하고 종료하십시오.

-v --버전
버전 정보를 출력하고 종료

-V --장황
상세 모드(경고+오류).

-W --경고
경고 모드, 경고 정보 인쇄

-E --오류
오류 모드, 오류 정보 인쇄

-D --디버그
디버그 모드, 디버그 정보 인쇄

환경 변수
GDCM_ROOT_UID 루트 UID

기술


VTK에서 지원하는 파일을 DICOM으로 변환합니다.

일반적인 사용법은 다음과 같습니다.

$ gdcm2vtk 입력파일 출력.dcm

VTK의 내부 팩토리 메커니즘을 사용하여 파일을 인식합니다(CanRead 기능). 보다
VTK 지원 파일:

VTK가 읽고 쓸 수 있는 이미지 파일 형식은 무엇입니까? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

입력 파일에 4개의 구성 요소가 있는 경우 4번째 구성 요소(알파)가 출력에서 ​​제거됩니다.
DICOM이 더 이상 알파 구성요소를 지원하지 않으므로 파일을 삭제합니다(–argb 옵션 참조).

다음 파일 형식에 대해 특별한 주의를 기울였습니다.

1. DICOM: 방향 코사인 및 vtkMedicalImageInformation이 출력으로 전달됩니다.
2. BMP: 조회 테이블과 함께 파일을 저장할 수 있습니다(--palette-color 참조).
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties가 출력으로 전달됩니다.
4. MINC: 방향 코사인이 출력으로 전달됩니다.
5. TIFF: vtkTIFFReader는 현재 VTK에서 상태가 좋지 않습니다(VTK 5.2 및 git/master에서는 다른 동작). 당신이 무엇을 하고 있는지 알고 있는 경우에만 사용하십시오.

변하게 하다 메타이미지 (mhd, 음하)
$ gdcm2vtk 입력파일 output.mha

이 명령은 입력 DICOM 파일: inputfile을 MetaImage .mha 파일로 변환합니다. 같은
.mhd 파일로 이동합니다.

변하게 하다 MHA/MHD
$ gdcm2vtk 입력파일 output.mha

or

$ gdcm2vtk 입력파일 output.mhd

이 명령은 입력 DICOM 파일을 변환합니다: inputfile을 MetaImageData .mha/.mhd로 변환합니다.
파일.

변하게 하다 VTI
$ gdcm2vtk 입력파일 output.vti

이 명령은 입력 DICOM 파일을 변환합니다. inputfile을 XML VTK ImageData .vti로 변환합니다.
파일.

변하게 하다 VTK
$ gdcm2vtk 입력파일 출력.vtk

이 명령은 입력 DICOM 파일: inputfile을 이전 VTK 구조로 변환합니다.
PointSets .vtk 파일.

변하게 하다 디컴


$ gdcm2vtk 입력.dcm 출력.dcm

vtkGDCM이미지 리더 기본값이 아닌 DICOM 파일을 읽는 데 사용됩니다.
vtkDICOMImageReader. vtkDICOMImageReader를 사용하려면 –use-vtkdicom 옵션을 참조하십시오.

왕복 여행 디컴 ~까지 MHD ~까지 디컴


$ gdcm2vtk 입력_ybr.dcm 출력.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 출력.mhd 출력.dcm

위의 참조 섹션은 광도 해석을 사용하여 DICOM을 변환하는 방법을 보여줍니다.
YBR_FULL(또는 YBR_FULL_422도 손실)을 다른 파일 형식인 MetaImage(mhd)로 변환합니다. 부터
이 파일 형식은 색 공간을 처리하지 않으므로 다음을 사용하여 명시적으로 설정해야 합니다.
–imageformat 명령줄 옵션. –modality 명령줄 옵션은 여기에 필요합니다.
기본 보조 캡처 이미지 스토리지 클래스 제품군이 YBR을 허용하지 않기 때문입니다.
측광 해석.

GDCM2VTK 노트


중요 참고 사항: 구조화된 내부 VTK는 입력 DICOM에서 채워진 다음
출력 DICOM 작성기로 전달합니다. 일부 정보는 변환 중에 손실될 수 있습니다.
DICOM에서 VTK로, DICOM으로. 이 옵션은 주로 테스트에 사용됩니다.
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter 조합.

중요 참고 사항: JPEG와 같은 손실 형식에서 변환할 때
손실이 중요합니다. 출력 DICOM에는 필요한 손실 이미지가 포함됩니다.
이미지가 어딘가에 손실 압축되었음을 나타내는 압축 속성
관로. gdcmimg(일반적인 JPEG 처리 개선)도 참조하십시오.

중요 참고 사항: –use-vtkdicom을 사용할 때 출력 DICOM 파일은 항상 다음과 같이 기록됩니다.
이 정보는 판독기 자체에서 사용할 수 없으므로 MR 이미지 저장소입니다. 이것은 허용
이미지 방향(환자)을 올바르게 설정합니다.

onworks.net 서비스를 사용하여 gdcm2vtk 온라인 사용


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