이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 macs2_bdgbroadcall 명령입니다.
프로그램:
이름
macs2_bdgbroadcall - ChIP 시퀀싱을 위한 모델 기반 분석
기술
사용법: macs2 bdgbroadcall [-h] -i IFILE [-c 컷오프피크] [-C 컷오프링크]
[-l 민렌] [-g LVL1MAXGAP] [-G LVL2MAXGAP]
[--outdir OUTDIR] (-o 오파일 | --o-접두사 O프리픽스)
optional 인수 :
-h, --도움
이 도움말 메시지를 표시하고 종료
-i 아이파일, --ifile 아이파일
bedGraph의 MACS 점수. 필수의
-c 컷오프피크, --컷오프 피크 컷오프피크
점수 추적에 사용한 방법에 따라 최고점에 대한 컷오프. 파일의 경우
MACS2의 qvalue 점수가 포함되어 있으며 점수 2는 qvalue 0.01을 의미합니다. 기본값: 2
-C 컷오프링크, --컷오프 링크 컷오프링크
사용한 방법에 따라 지역 연결/풍부도가 낮은 지역에 대한 컷오프
점수 트랙용. 파일에 MACS2의 qvalue 점수가 포함되어 있는 경우 점수 1은
qvalue는 0.1이고, Score 0.3은 qvalue 0.5를 의미합니다. 기본값: 1
-l 민렌, --최소 길이 민렌
피크의 최소 길이는 d 값으로 설정하는 것이 좋습니다. 기본값: 200
-g LVL1MAXGAP, --lvl1-최대 간격 LVL1MAXGAP
중요한 피크 사이의 최대 간격을 태그 크기로 설정하는 것이 좋습니다. 기본값: 30
-G LVL2MAXGAP, --lvl2-최대 간격 LVL2MAXGAP
중요한 피크 사이의 최대 연결은 d 값의 4배로 설정하는 것이 좋습니다.
기본값: 800
--outdir 아웃디어
지정하면 모든 출력 파일이 해당 디렉토리에 기록됩니다. 기본값:
현재 작업 디렉토리
-o 파일, --offile 파일
출력 파일 이름. 와 상호 배타적 --o-접두사.
--o-접두사 접두사
출력 파일 접두사. 와 상호 배타적 -o/--파일.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 macs2_bdgbroadcall을 사용하세요.