이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 msconvert 명령입니다.
프로그램:
이름
msconvert — 질량 분석 데이터 파일 형식을 변환합니다.
개요
msconvert [옵션] [파일 마스크]
기술
이 매뉴얼 페이지는 간략하게 설명합니다 msconvert 소프트웨어 libpwiz 도구
패키지. 이 프로그램을 사용하면 질량 분석 데이터 파일을 하나의 형식으로 변환할 수 있습니다.
다른 사람에게. 이 버전은 자유 소프트웨어 데비안 플랫폼에서 만들어졌기 때문에
자유 소프트웨어와 관련된 전환은 수행될 수 있습니다[즉, 소유권을 포함하지 *않습니다*.
Microsoft Windows 기반 동적 연결 라이브러리(dll)].
옵션
-v | --말 수가 많은
자세한 처리 진행 정보를 표시합니다.
--help 필터 옵션에 대한 추가 세부 정보와 함께 이 메시지를 표시합니다.
-f | --파일 목록 파일 이름
의 내용을 사용합니다. 파일 이름 파일 이름을 나열합니다.
-오 | --outdir DIR
출력 디렉토리(stdout의 경우 '-')를 다음으로 설정합니다. DIR. 기본적으로 출력
디렉토리는 '.' (즉, 현재 작업 디렉토리).
-c | --구성 파일 이름
구성 파일을 다음으로 설정하십시오. 파일 이름.
--아웃파일 파일 이름
출력 파일의 이름을 재정의합니다.
-e | --ext 내선
출력 파일의 확장자를 다음으로 설정하십시오. 내선. mzML 또는 mzXML 또는 mgf 또는
txt.
--mzML 쓰기 mzML 형식(기본값).
--mzXML 쓰기 mzXML 형식입니다.
--mgf 쓰기 mgf 마스코트 일반 형식.
--text ProteoWizard 내부 쓰기 본문 형식입니다.
--ms1 쓰기 MS1 형식입니다.
--cms1 쓰기 CMS1 형식입니다.
--ms2 쓰기 MS2 형식입니다.
--cms2 쓰기 CMS2 형식입니다.
--64 기본 이진 인코딩을 64비트 정밀도(기본값)로 설정합니다.
--32 기본 이진 인코딩을 32비트 정밀도로 설정합니다.
--mz64 m/z 값을 64비트 정밀도로 인코딩합니다(기본값).
--mz32 m/z 값을 32비트 정밀도로 인코딩합니다.
--inten64 강도 값을 64비트 정밀도로 인코딩합니다.
--inten32 강도 값을 32비트 정밀도로 인코딩합니다(기본값).
--noindex 인덱스를 쓰지 않습니다.
-i | --연락처 정보 파일 이름
파일 이름 연락처 정보.
-z | --zlib
바이너리 데이터에 zlib 압축을 사용하십시오.
-g | --gzip
gzip 전체 출력 파일(파일 이름에 .gz 추가).
--필터 아르헨티나
스펙트럼 목록 필터를 추가합니다.
--merge 파일 수준을 병합하여 여러 입력 파일에서 단일 출력 파일을 만듭니다.
메타데이터 및 연결 스펙트럼 목록.
--simAsSpectra
선택한 이온 모니터링을 크로마토그램이 아닌 스펙트럼으로 기록합니다.
--srmAsSpectra
선택한 반응 모니터링을 크로마토그램이 아닌 스펙트럼으로 작성합니다.
사용 예
data.RAW를 data.mzXML로 변환
msconvert 데이터.RAW --mzXML
출력 파일을 my_output_dir에 넣습니다.
msconvert 데이터.RAW -o 내_출력_디렉터리
스캔 인덱스 5...10 및 20...25 추출
msconvert 데이터.RAW --필터 "색인 [5,10] [20,25]"
MS1 스캔만 추출
msconvert 데이터.RAW --필터 "msLevel 1"
n>1에 대한 MSn 스캔 추출
msconvert 데이터.RAW --필터 "msLevel 2-"
구성 파일 사용
msconvert 데이터.RAW -c 구성.txt
RETURN VALUE
실패한 파일의 수입니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 msconvert 사용
