์ด๊ฒ์ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MAC OS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ์ ๊ฐ์ ์ฌ๋ฌ ๋ฌด๋ฃ ์จ๋ผ์ธ ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ค ํ๋๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ OnWorks ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์์ ์คํํ ์ ์๋ nipy_tsdiffana ๋ช ๋ น์ ๋๋ค.
ํ๋ก๊ทธ๋จ:
์ด๋ฆ
nipy_tsdiffana - ์๊ณ์ด ์ฐจ์ด ์ธก์ ํญ๋ชฉ ๋ถ์, ํ๋กฏ
๊ธฐ์
์ฌ์ฉ๋ฒ: nipy_tsdiffana [-h] [--out-file OUT_FILE] [--write-results]
[--์์-๊ฒฝ๋ก OUT_PATH]
[--out-fname-label OUT_FNAME_LABEL] [--์๊ฐ์ถ TIME_AXIS] [--์ฌ๋ผ์ด์ค์ถ
SLICE_AXIS] ํ์ผ ์ด๋ฆ
์๊ณ์ด ์ฐจ์ด ์ธก์ ํญ๋ชฉ ๋ถ์, ํ๋กฏ
์์น ์ธ์ :
ํ์ผ ์ด๋ฆ
4D ์ด๋ฏธ์ง ํ์ผ ์ด๋ฆ
optional ์ธ์ :
-h, --๋์
์ด ๋์๋ง ๋ฉ์์ง๋ฅผ ํ์ํ๊ณ ์ข ๋ฃ
--์์ ํ์ผ OUT_FILE
ํ๋ฉด์ ์ด๋ฏธ์ง๋ฅผ ๋จ๊ธฐ๋ ๋์ ์ธ ๊ทธ๋ํฝ ํ์ผ
--์ฐ๊ธฐ ๊ฒฐ๊ณผ
์ง์ ๋ ๊ฒฝ์ฐ ์ง๋จ ์ด๋ฏธ์ง์ ๋ถ์ ๋ณ์๋ฅผ ์์ฑํ๊ณ OUT_PATH์ ํ๋กฏํฉ๋๋ค.
OUT_FILE๊ณผ ์ํธ ํธํ๋์ง ์์ต๋๋ค.
--์์ ๊ฒฝ๋ก OUT_PATH
์ถ๋ ฅ ์ด๋ฏธ์ง ํ์ผ์ ๊ฒฝ๋ก(๊ธฐ๋ณธ๊ฐ์ FILENAME ๊ฒฝ๋ก)
--out-fname-๋ ์ด๋ธ OUT_FNAME_LABEL
์ถ๋ ฅ ์ด๋ฏธ์ง/ํ๋กฏ ํ์ผ ์ด๋ฆ์ ์ค๊ฐ ๋ถ๋ถ
--์๊ฐ์ถ TIME_์ถ
์๊ฐ์ ๋ํ ์ด๋ฏธ์ง ์ถ
--์ฌ๋ผ์ด์ค ์ถ SLICE_AXIS
์ฌ๋ผ์ด์ค์ ์ด๋ฏธ์ง ์ถ
nipy_tsdiffana๋ 4D ์ด๋ฏธ์ง ๋ณผ๋ฅจ์ ๋ํด ์๊ณ์ด ์ฐจ์ด ์๊ณ ๋ฆฌ์ฆ์ ์คํํฉ๋๋ค.
FMRI ๋ณผ๋ฅจ.
๋ค์ ์ธ ๊ฐ์ง ๋ชจ๋ ์ค ํ๋๋ก ์๋ํฉ๋๋ค.
* ๋ํํ: ์๊ณ์ด ์ฐจ์ด ํ๋กฏ์ด ํ๋ฉด์ ๋ํ๋ฉ๋๋ค. ์ด๊ฒ์ด
๊ธฐ๋ณธ ๋ชจ๋
* ๋น๋ํํ, ํ๋กฏ ์ ์ฉ: ์๊ณ์ด ์ฐจ์ด ํ๋กฏ์ ๊ทธ๋ํฝ์ ์์ฑ
ํ์ผ. "--out-file= ์ฌ์ฉ " ์ด ๋ชจ๋๋ฅผ ํ์ฑํํ๋ ์ต์
* ๋น๋ํํ, ํ๋กฏ, ์ด๋ฏธ์ง ๋ฐ ๋ณ์ ์ฐ๊ธฐ: ํ์ผ์ ํ๋กฏ ์ฐ๊ธฐ ๋ฐ
์์ฑ๋ ์ง๋จ ์ด๋ฏธ์ง์ ๋ณ์๋ ํ์ผ์ ๊ธฐ๋กํฉ๋๋ค. ์ฌ์ฉ
์ด ์ต์ ์ ํ์ฑํํ๋ ค๋ฉด "--write-results" ํ๋๊ทธ๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ธ์. ์์ฑ๋ ํ์ผ ์ด๋ฆ์ ์ถ์ฒ๋ ๋ค์๊ณผ ๊ฐ์ต๋๋ค.
"--out-path" ๋ฐ "--out-fname-label" ์ต์ ์ ๊ฒฐ๊ณผ(๋์๋ง ์ฐธ์กฐ)
์ฐ๊ธฐ ๊ฒฐ๊ณผ ์ต์ , ์์ฑ๋ ํ์ผ -------------------------------------
์์ ๋ถ์์ ํ ๋ ๊ฐ ์์ ๊ฐ์ ์ฐจ์ด ๋ณผ๋ฅจ์ ๋ง๋ญ๋๋ค.
ํฌ์ธํธ์ ์๋ฆฌ์ฆ์ ๋ค์ ์์ . T ๋ณผ๋ฅจ์ด ์๋ ๊ฒฝ์ฐ
(T-1) ์ฐจ์ด ๋ณผ๋ฅจ. ์๋ก ๋ค๋ฅธ ๋ถํผ์ ๋ฒกํฐ DV๋ฅผ ํธ์ถํ๊ณ ์ฒซ ๋ฒ์งธ
์ฐจ์ด ๋ณผ๋ฅจ DV[0]. ๋ฐ๋ผ์ DV[0]์ 4D์์ ๋ ๋ฒ์งธ ๋ณผ๋ฅจ์ ๋บ ๊ฒฐ๊ณผ์ ๋๋ค.
4D ์ ๋ ฅ ์ด๋ฏธ์ง์ ์ฒซ ๋ฒ์งธ ๋ณผ๋ฅจ์์ ์ ๋ ฅ ์ด๋ฏธ์ง. ์์๋ณ ์ ๊ณฑ ๊ฐ
DV[0]์ ๊ฐ์ *DV2[0]*์ ๋๋ค.
๋ค์ ์ด๋ฏธ์ง๊ฐ ์์ฑ๋ฉ๋๋ค. ์ ๋ ฅ ํ์ผ ์ด๋ฆ ํ์ฅ์์ ๋๋ค(์:
'.nii'):
* "dv2_max_ " : ๊ฐ ์ฌ๋ผ์ด์ค S๊ฐ ์ฌ๋ผ์ด์ค๋๋ 3D ์ด๋ฏธ์ง ๋ณผ๋ฅจ
ํฉ์ฐ๋ ์ต๋๊ฐ์ ๊ฐ๋ DV2[T-0](์ฌ๋ผ์ด์ค S)๋ถํฐ DV2[1](์ฌ๋ผ์ด์ค S) ์ ์ฒด
์ ๊ณฑ ๊ฐ. ์ด ๋ณผ๋ฅจ์ ์ต์ ์(๊ฐ์ฅ ํฐ ์ฐจ์ด) ์กฐ๊ฐ์ ๋ํ ์์ด๋์ด๋ฅผ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค.
์ ์ฒด ์๊ณ์ด์ ๊ฑธ์ณ.
* "dv2_mean_ " : ๋ชจ๋ DV2 ๋ณผ๋ฅจ์ ํ๊ท DV2[0] .. DV[T-1]
๋ณผ๋ฅจ(์๊ฐ) ์ฐจ์์ ๊ฑธ์ณ.
์ด ๋ณผ๋ฅจ์ ๋ณต์ ๊ฐ์ด ๋์์๋ก
์ด ๋ณต์ ์์๋ ์์ ๊ฐ ์ฐจ์ด๊ฐ ๋์ ๊ฒฝํฅ์ด ์์์ต๋๋ค.
๋ํ ๊ฐ ์์ ์ ํ๊ท ์ ํธ์ ๋ ์์ ๊ฐ์ ํ๊ท ์ ๊ณฑ ์ฐจ์ด๋ฅผ ๊ธฐ๋กํฉ๋๋ค.
"tsdiff_ .npz" ๋ผ๋ ์ด๋ฆ์ 'npz' ํ์ผ์ ๋ํ ๋ณ์๋ก ์๊ฐ์ ๊ฐ ์กฐ๊ฐ
์ถ๋ ฅ ํ์ผ ์ด๋ฆ์ ํ์์ ๋ค์๊ณผ ๊ฐ์ต๋๋ค. /
์ด๋ ์์ ์ง์ ํ ๊ฒฝ๋ก์ ๋๋ค. --์์ ๊ฒฝ๋ก ์ต์ ๋๋ ์ ๋ ฅ ๊ฒฝ๋ก
ํ์ผ ์ด๋ฆ; ์์ ํ์ค ์ ๋์ฌ ์ค ํ๋์ด๋ฉฐ ๋ค์๊ณผ ๊ฐ์ด ์ง์ ๋ฉ๋๋ค.
--out-๋ ์ด๋ธ, ๋๋ ์ ๋ ฅ ์ด๋ฏธ์ง์ ํ์ผ ์ด๋ฆ(๊ฒฝ๋ก ๋ฐ ํ์ฅ์๊ฐ ์ ๊ฑฐ๋จ) ๋ฐ
๊ทธ๋ํฝ์ ๊ฒฝ์ฐ '.png'์ด๊ณ ๋ณผ๋ฅจ์ ๊ฒฝ์ฐ ์ ๋ ฅ ํ์ผ ์ด๋ฆ ํ์ฅ์์ ๋๋ค.
์ด๋ฏธ์ง. ์๋ฅผ ๋ค์ด ์ ๋ ฅ ํ์ผ ์ด๋ฆ ``/some/path/fname.img``๋ง ์ง์ ํ๋ฉด
``/some/path/tsdiff_fname.png ํ์์ ํ์ผ ์ด๋ฆ์ ์์ฑํฉ๋๋ค.
/some/๊ฒฝ๋ก/dv2_max_fname.img`` ๋ฑ
onworks.net ์๋น์ค๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ nipy_tsdiffana ์ฌ์ฉ